| Transcript alias | Gene Alias | Length | Confidence |
|---|---|---|---|
| Jregia_Jr_Scaffold_120_00040_p1 | Jregia Jr Scaffold 120 00040 | 360 | High |
| Jregia_Jr_Scaffold_2_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 2 00010 | 446 | Low |
| Jregia_Jr_Scaffold_21398_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 21398 00010 | 303 | High |
| Jregia_Jr_Scaffold_23753_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 23753 00010 | 336 | Low |
| Jregia_Jr_Scaffold_251_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 251 00010 | 616 | Low |
| Jregia_Jr_Scaffold_30_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 30 00010 | 324 | Low |
| Jregia_Jr_Scaffold_651_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 651 00010 | 360 | Low |
| Jregia_Jr_Scaffold_77_00010_p1 | Jregia Jr Scaffold 77 00010 | 643 | High |
| Jregia_Jr_Scaffold_77_00020_p1 | Jregia Jr Scaffold 77 00020 | 410 | Low |
| Jregia_Jr01_01060_p1 | Jregia Jr01 01060 | 417 | High |
| Jregia_Jr01_01710_p2 | Jregia Jr01 01710 | 1,992 | Low |
| Jregia_Jr01_02790_p1 | Jregia Jr01 02790 | 357 | High |
| Jregia_Jr01_02880_p1 | Jregia Jr01 02880 | 873 | High |
| Jregia_Jr01_03210_p1 | Jregia Jr01 03210 | 659 | Low |
| Jregia_Jr01_03560_p1 | Jregia Jr01 03560 | 318 | Low |
| Jregia_Jr01_06770_p1 | Jregia Jr01 06770 | 1,022 | Low |
| Jregia_Jr01_07470_p2 | Jregia Jr01 07470 | 930 | High |
| Jregia_Jr01_07860_p3 | Jregia Jr01 07860 | 626 | High |
| Jregia_Jr01_08000_p1 | Jregia Jr01 08000 | 342 | Low |
| Jregia_Jr01_09290_p1 | Jregia Jr01 09290 | 629 | Low |
| Jregia_Jr01_09760_p1 | Jregia Jr01 09760 | 330 | High |
| Jregia_Jr01_10030_p1 | Jregia Jr01 10030 | 635 | High |
| Jregia_Jr01_10550_p1 | Jregia Jr01 10550 | 370 | High |
| Jregia_Jr01_10880_p1 | Jregia Jr01 10880 | 683 | Low |
| Jregia_Jr01_13140_p1 | Jregia Jr01 13140 | 315 | High |
| Jregia_Jr01_13250_p2 | Jregia Jr01 13250 | 1,849 | Low |
| Jregia_Jr01_13280_p1 | Jregia Jr01 13280 | 583 | High |
| Jregia_Jr01_13330_p1 | Jregia Jr01 13330 | 583 | High |
| Jregia_Jr01_15360_p1 | Jregia Jr01 15360 | 601 | Low |
| Jregia_Jr01_15880_p5 | Jregia Jr01 15880 | 1,148 | Low |
| Jregia_Jr01_15930_p1 | Jregia Jr01 15930 | 303 | High |
| Jregia_Jr01_18840_p1 | Jregia Jr01 18840 | 528 | Low |
| Jregia_Jr01_18910_p1 | Jregia Jr01 18910 | 312 | High |
| Jregia_Jr01_20150_p1 | Jregia Jr01 20150 | 648 | High |
| Jregia_Jr01_20310_p1 | Jregia Jr01 20310 | 736 | High |
| Jregia_Jr01_21050_p1 | Jregia Jr01 21050 | 322 | High |
| Jregia_Jr01_21060_p1 | Jregia Jr01 21060 | 324 | High |
| Jregia_Jr01_21200_p1 | Jregia Jr01 21200 | 387 | High |
| Jregia_Jr01_22160_p1 | Jregia Jr01 22160 | 330 | High |
| Jregia_Jr01_22170_p1 | Jregia Jr01 22170 | 327 | High |
| Jregia_Jr01_22210_p1 | Jregia Jr01 22210 | 351 | Low |
| Jregia_Jr01_22280_p1 | Jregia Jr01 22280 | 306 | Low |
| Jregia_Jr01_22470_p1 | Jregia Jr01 22470 | 318 | High |
| Jregia_Jr01_22480_p1 | Jregia Jr01 22480 | 318 | High |
| Jregia_Jr01_22670_p1 | Jregia Jr01 22670 | 1,095 | Low |
| Jregia_Jr01_23460_p2 | Jregia Jr01 23460 | 1,249 | Low |
| Jregia_Jr01_23960_p1 | Jregia Jr01 23960 | 333 | High |
| Jregia_Jr01_23970_p1 | Jregia Jr01 23970 | 339 | High |
| Jregia_Jr01_24500_p1 | Jregia Jr01 24500 | 614 | High |
| Jregia_Jr01_24810_p1 | Jregia Jr01 24810 | 492 | High |