| Gene alias | Chrom. | Start | End | Num. of lncRNAs |
|---|---|---|---|---|
| Csativus Cucsa.000220 | scaffold00009 | 14057 | 14266 | 1 |
| Csativus Cucsa.002310 | scaffold00032 | 72910 | 73327 | 1 |
| Csativus Cucsa.002330 | scaffold00032 | 88604 | 89039 | 1 |
| Csativus Cucsa.002540 | scaffold00033 | 18608 | 25307 | 1 |
| Csativus Cucsa.002670 | scaffold00033 | 230013 | 230440 | 1 |
| Csativus Cucsa.002890 | scaffold00034 | 44340 | 44571 | 1 |
| Csativus Cucsa.002960 | scaffold00034 | 155433 | 157270 | 1 |
| Csativus Cucsa.003920 | scaffold00046 | 64111 | 65410 | 1 |
| Csativus Cucsa.004940 | scaffold00055 | 26701 | 26919 | 1 |
| Csativus Cucsa.004960 | scaffold00055 | 57264 | 57699 | 1 |
| Csativus Cucsa.005000 | scaffold00055 | 86463 | 88780 | 1 |
| Csativus Cucsa.005210 | scaffold00055 | 289911 | 290363 | 1 |
| Csativus Cucsa.005260 | scaffold00055 | 334528 | 335041 | 1 |
| Csativus Cucsa.005330 | scaffold00055 | 442080 | 442498 | 1 |
| Csativus Cucsa.005410 | scaffold00055 | 499371 | 503731 | 2 |
| Csativus Cucsa.005570 | scaffold00055 | 628876 | 630168 | 1 |
| Csativus Cucsa.005770 | scaffold00058 | 319 | 528 | 1 |
| Csativus Cucsa.006180 | scaffold00067 | 61981 | 63001 | 1 |
| Csativus Cucsa.006190 | scaffold00067 | 67212 | 67893 | 1 |
| Csativus Cucsa.006200 | scaffold00067 | 69790 | 70053 | 1 |
| Csativus Cucsa.006540 | scaffold00071 | 59 | 474 | 1 |
| Csativus Cucsa.006740 | scaffold00081 | 366 | 634 | 1 |
| Csativus Cucsa.007270 | scaffold00089 | 134756 | 135520 | 1 |
| Csativus Cucsa.007800 | scaffold00095 | 10210 | 10592 | 1 |
| Csativus Cucsa.007830 | scaffold00095 | 17875 | 19416 | 1 |
| Csativus Cucsa.007860 | scaffold00095 | 38092 | 38573 | 1 |
| Csativus Cucsa.008900 | scaffold00122 | 33483 | 37062 | 1 |
| Csativus Cucsa.009170 | scaffold00123 | 126398 | 126960 | 1 |
| Csativus Cucsa.009220 | scaffold00123 | 189650 | 190368 | 1 |
| Csativus Cucsa.009270 | scaffold00123 | 253907 | 254107 | 1 |
| Csativus Cucsa.009320 | scaffold00123 | 323769 | 324037 | 1 |
| Csativus Cucsa.009770 | scaffold00142 | 75 | 508 | 1 |
| Csativus Cucsa.010590 | scaffold00154 | 23964 | 24509 | 1 |
| Csativus Cucsa.010730 | scaffold00154 | 134988 | 135281 | 1 |
| Csativus Cucsa.010790 | scaffold00154 | 187606 | 188578 | 1 |
| Csativus Cucsa.010940 | scaffold00154 | 309759 | 311816 | 1 |
| Csativus Cucsa.011140 | scaffold00154 | 451378 | 452320 | 1 |
| Csativus Cucsa.011230 | scaffold00154 | 520518 | 521279 | 1 |
| Csativus Cucsa.011260 | scaffold00154 | 539793 | 541996 | 1 |
| Csativus Cucsa.011290 | scaffold00154 | 576427 | 576729 | 1 |
| Csativus Cucsa.011430 | scaffold00154 | 683547 | 684032 | 1 |
| Csativus Cucsa.011500 | scaffold00154 | 728755 | 731656 | 1 |
| Csativus Cucsa.011580 | scaffold00154 | 801872 | 803337 | 1 |
| Csativus Cucsa.011670 | scaffold00154 | 977373 | 983626 | 1 |
| Csativus Cucsa.011680 | scaffold00154 | 990387 | 990599 | 1 |
| Csativus Cucsa.011870 | scaffold00154 | 1256736 | 1256955 | 1 |
| Csativus Cucsa.011950 | scaffold00154 | 1339561 | 1340381 | 1 |
| Csativus Cucsa.012190 | scaffold00154 | 1673849 | 1674237 | 1 |
| Csativus Cucsa.012480 | scaffold00164 | 47564 | 47943 | 1 |
| Csativus Cucsa.012510 | scaffold00164 | 66923 | 67296 | 1 |